Στο πλαίσιο εκπόνησης της στατικής μελέτης ανάπλασης του σταθμού Θησείου υλοποιήθηκαν τα παρακάτω έργα: νέες αποβάθρες και η κάλυψή τους με μεταλλικό στέγαστρο, νέο διώροφο κτίριο γραφείων και εγκαταστάσεων, κατασκευή προσβάσεων (σκάλες, ράμπες), κατασκευή νέας πεζογέφυρας από οπλισμένο σκυρόδεμα και κατασκευή μεταλλικού χωροδικτυώματος. Σε όλη την έκταση του έργου γίνονται επεμβάσεις και ενισχύσεις στις υπάρχουσες κατασκευές. Για ιστορικούς λόγους ( ο σταθμός κατασκευάστηκε το 1886) και για λόγους αισθητικής έγινε προσπάθεια ώστε όλος ο χαρακτήρας των επεμβάσεων να ενταχθεί διακριτικά και να εναρμονιστεί με την ιστορία του σταθμού.